Além do Parque Estadual Cunhambebe, outras sete unidades de conservação administradas pelo Inea integram a Reserva da Biosfera da Mata Atlântica: os parques estaduais de Ilha Grande, na Costa Verde; da Serra da Concórdia, no Centro Sul fluminense; da Serra da Tiririca, em Niterói; da Costa do Sol, na Região dos Lagos; e do Desengano, no Norte Fluminense; da Pedra Branca, na Zona Oeste da cidade; e a Reserva Biológica Estadual de Guaratiba, também na Zona Oeste do Rio.
