Com relação aos problemas na ferramenta, a auditoria apontou um aumento significativo no númeo de concessões de auxílios-doença de longa duração, especialmente a partir de agosto de 2023, quando o Atestmed passou a ser usado de forma mais intensiva, segundo o acórdão de 2.746, de 2025, do TCU. Além disso, houve alta na quantidade dos pedidos de benefício por incapacidade temporária.
